日本东部和南部为一望无际的太平洋，西临日本海、东海，北接鄂霍次克海，隔海分别和朝鲜、韩国、中国、俄罗斯、菲律宾等国相望。

日本是一个四面临海的岛国，日本的岛屿呈北东向延伸得很长，自东北向西南呈弧状延伸，南北跨越纬度约20度，日本群岛地处位于亚欧板块和太平洋板块的交界地带，即环太平洋火山地震带，火山、地震活动频繁，危害较大的地震平均3年就要发生1次。

日本是一个多山的岛国，山地成脊状分布于日本的中央，将日本的国土分割为太平洋一侧和日本海一侧，山地和丘陵占总面积的71%，大多数山为火山，国土森林覆盖率高达67%。

日本的平原主要分布在河流的下游近海一带，多为冲积平原，规模较小，较大的平原有石狩平原、越后平原、浓尾平原、十胜平原等，其中面积最大的平原为关东平原。

日本平原面积狭小，耕地十分有限，人口生理密度高达2924人/平方公里，为世界第26位。

富士山是日本的最高峰，海拔3776米，是日本最高峰，被日本人尊称为：圣岳。

日本北海道有世界最著名的渔场：北海道渔场，其成因是千岛寒流与日本暖流交汇。