“奎星楼”是书院主体建筑。建于乾隆十八年。其主楼魁星楼高二层，绿瓦、红廊、白墙，是一座具有民族特色的砖木结构建筑，至今保存完好。

　　魁星楼二楼中梁正中悬挂一匾，上书''进士''二字，字大如斗。这是当年该书院的高材生张日中进士后朝廷所赐。楼内雕梁画栋，异常别致;楼前绿树成荫，环境秀丽雅静。

　　琼台书院为清代琼州最高学府，常设执教并主持院政的掌教一人，由道台从德高望重的进士或举人中聘任。琼台书院从创建之初就是海南人读书登科之地，曾培养了一大批文人墨客，清代琼籍之进士、举人多数入第前曾在此攻读。著名的粤剧、琼剧《搜书院》的故事就发生在此。当时，书生张生和琼州府镇台的婢女产生爱情，镇台震怒严惩婢女，婢女逃进书院求救，镇台派人追至，书院掌教谢宝仗义执言，门前挡驾，并机智地乘夜将婢女送出城外，使张生与婢女终成眷属。琼台书院随着《搜书院》而蜚声海内外。