首先是割让香港岛，损害了中国领土主权的完整。香港岛控制广州的出海口，商业上，占领香港岛就能打击广州贸易；军事上，可以控制广州和中国东南沿海，因此英军选择香港岛为在华据点。

南京条约危害图

其次是赔偿巨款2100万元，相当清政府全年财政收入的三分之一。当时的清政府因为鸦片的大量输入，已经在中英贸易上占弱势，英国利用鸦片完成了资本的原始积累后，又以鸦片战争为借口，向清政府要求赔偿。清政府因为官员腐败贪污，各种挥霍，国库已经亏空，无奈之下只能搜刮民脂民膏，给百姓增加赋税，这一举动无疑加剧了中国的贫弱，加重了人民的负担，这在一定程度上导致了农民起义。

再来是五口通商，通商口岸的开放无疑是向西方列强打开了中国的大门，方便了外国资本主义势力的侵入，有利于外国资本主义的商品输出。便利了资本主义国家的商品货物等，包括鸦片，大量涌入中国，使中国经济日益半殖民地化。造成中国东南沿海手工业者大量破产，中国自给自足的自然经济开始解体，中国的社会性质开始发生变化。

最后是商定关税，中国失去了关税自主权，中国向英国出口商品，其关税需要与英国商量，但是英国向中国出口商品，英国却不需要与中国商量。即英国将货物运到中国便宜卖，买的人多，获利也多。中国不能自己调整税率，海关形同虚设，中国成为西方国家商品货物的倾销地，中国本身的经济体制破产，中国民族工业发展艰难，中国开始沦为半殖民地半封建国家。