明朝建立初期，为了完善边疆地区的管理，加强了对边疆少数民族的管辖。先后采取了一系列的政治、军事策略。在朱元璋在位期间，明朝在西藏设立乌斯藏都指挥司，还安排了藏族僧侣充任宣慰使、宣抚使还有安抚使等官职。目的就是借助他们在西藏本地的威望，对西藏实施有效的管理。

然后在哈密地区，则封他们那边的统治者为忠顺王，代理朝廷掌管西域事务。至于云南、贵州等地区，长期以来就是各种少数民族聚集人数最多的地方，历代的中央政府，都很难将权力伸到这一块地方。于是朱元璋就设立了土司一职，也是专门任用当地少数民族的人，让他们专门负责本地的防务管理。

1409年，朱元璋已经去世，但是他的后代也非常注重对少数民族管理这一块。在东北地区设置了奴儿干都司，负责管理西边额嫩河，东边库页岛，南边日本海，北边外兴安岭这一整块的辽阔地区。而且还在那里驻守军队、设置驿站。总之明朝统一战争为后来专制主义中央集权的加强还有社会经济的迅速恢复提供了坚实的基础。