隆安三年(399年)，其父吕光病重，以吕纂为太尉、统率六军来辅佐吕绍。吕绍继位不久，吕纂篡位自立，改年号为咸宁。吕纂继位之后，其弟吕弘起兵反叛，吕弘兵败，被吕纂所派的大力士康龙杀死。又出兵征伐南凉，被南凉军挫败而仓惶撤军。吕纂在位时，出游打猎没有节制，沉溺酒色，不听大臣劝谏。隆安五年(401年)，吕纂被其堂兄弟吕隆、吕超等人杀害，吕隆即位后，谥吕纂为灵皇帝，葬于白石陵。

　　轶事典故

　　安据盗墓

　　即序胡人安据盗掘了前凉君主张骏的墓，见到张骏的面貌还像活着似的，得到了珍珠帘、琉璃榼、白玉樽、赤玉箫、紫玉笛、珊瑚鞭、玛瑙钟，水陆奇珍异宝不可胜记。吕纂诛杀安据的党羽共五十多家，派使者吊祭张骏，并且修缮好他的墓。

　　修行德政

　　僧人鸠摩罗什对吕纂说：“潜藏的龙多次出现，猪狗现出妖形，将会有下人谋害皇上的祸害，应该进一步修行德政，来回答上天的告诚。”吕纂采纳了他的意见。

　　斩胡奴头

　　当初，吕纂曾和鸠摩罗什下棋，吃掉鸠摩罗什的棋子时，说：“砍掉胡奴的头。”鸠摩罗什说：“不砍胡奴头，胡奴砍人的头。”吕超小名叫胡奴，最终吕纂被吕超杀了。

　　历史评价

　　魏收《魏书》：“性多猜忌，忍于杀戮。”

　　房玄龄《晋书》：①“绍、纂凡才，负乘致寇。” ;②“少便弓马，好鹰犬。”;③“纂游田无度，荒耽酒色。”;④“纂昏虐任情，游田无度，耽荒酒色。”

　　《十六国春秋》：“少便弓马，不好书。”