慧能的真身曾经被毁坏过，有说法说是1937年，日本入侵中国国土之后，曾经破坏过慧能禅师的真身。因为他们宣扬的是要亲日，是要将中国同化，他们要入侵中国就不需要中国的文化，他们需要的是中国人全盘接受日本的所有，不反抗的接受，所以他们损毁了象征中国佛教的惠能的真身。也有说是文革时期，红卫兵不信真有真身不腐之说，将慧能的真身破坏了，这两种说法目前均有人力证有人反对，说法不一而足。

目前，惠能禅师的真身被放在了广东韶光，也正因此使得这里成为世界佛教圣地。每年都有数以万计的人来到这里向惠能禅师的真身顶礼膜拜。这不仅仅是惠能禅师的真身，更是世界佛学的里程碑，僧侣们的拜祭不仅仅是对惠能禅师的尊敬，更多的是为了表达他们对惠能禅师的尊敬，对佛教的崇敬之情。中国佛教的创始人，中国文化的融合者。惠能禅师的真身在现今看来意义更加深厚，现在时代更多的是谋求合作，求同存异，惠能禅师的佛教经典就是深深地传扬了这点，所以历代的统治者也很推崇惠能禅师。