后来两人的矛盾越积越深，藩将张良弼、脱烈伯、孔兴等人，推李思齐为盟主，共同对抗王保保。皇太子出来当和事佬，建议以关中为界限，李思齐负责关中以西，王保保负责关中以东。但李思齐因为是皇帝一派，不是太子一派，所以不听太子的安排。接着元顺帝又因为王保保是太子一派，让李思齐攻打王保保。可以说，整个元廷打成一片。

　　正是元廷的混乱，让朱元璋有了崛起的时间，在他打败劲敌陈友谅后，基本上没有人能与他抗衡了。朱元璋开始稳步北上，进攻元朝，这期间收服了战败的李思齐。

　　后来，朱元璋想要得到元将王保保，于是派李思齐为使者，前去招降王保保。李思齐备好了礼物前去，王保保见到李思齐后也是礼遇有加，好好的招待了一番，并表示会考虑投降朱元璋的事。李思齐要回去的时候，王保保还专门派了一队骑兵护送。然而送到边境的时候，骑兵对李思齐说，我们主帅说了，请你留下一点礼物再走。李思齐心想，礼物不是早就送了吗?骑兵接着说，我们主帅要你一只手臂。李思齐于是自断一臂，送给骑兵。然而李思齐回去后，却因为伤势过重，不治身亡。

　　李思齐作为劝降使者，被朱元璋派去劝降返回，被王保保要求“留下一臂”的时候，李思齐为什么那么听话呢?其实原因很简单。他要不“留下一臂”，王保保就会杀他。算他当时能逃掉，王保保就会以这个为借口，拒绝投降，朱元璋大概率还会杀他，横竖都是一死。如果他像王保保那样，始终不投降，可能也不会落到这个下场。