还有一种说法认为朱棣的生母是元妃。王世懋《窥天外乘>记载：“成祖皇帝为高皇后第四子甚明。而《野史》尚谓是元主妃所生。”王世懋所指的“野史”，是指《蒙古源流》。《蒙古源流》说，明成祖是元顺帝之妃瓮与前夫合葬是怕给后人留下笑柄。考证清史，清东陵所有别葬诸后，都是在风水墙内，唯有孝庄太后葬在风水墙外;孝庄太后死后，亦以当时有叛乱为借口而未按惯例全国举哀。此外，孝庄太后之浮厝在康熙时拆迁到“暂安殿”内一停就是近40年;直至雍正朝下葬时，雍正又不亲临祭祀。通过这些可以看出，孝庄太后的子孙后代，也都以她“下嫁”一事为憾。

　　也有人对此提出反驳，例如认为“亲到皇宫内院”虽可理解为秽乱宫廷，但是秽乱的对象却并不是确指庄妃。庄妃所以不与皇太极合葬，是因为皇太极身边早已经有孝瑞文皇后合葬在先。《朝鲜仁祖实录》的记载出自远道敌国、邻国的诬传和诳传，没有任何的凭据，也是不足信的。至于说多尔衮娶妻，实际上他所娶的是豪格的妻子博尔济吉锦氏，于庄妃的姓氏博尔济吉特氏读音相近，才会导致不知道内情的人以讹传讹，附会到庄妃的名下。

　　究竟孝庄皇后是否为了政治目的下嫁给多尔衮，史料中的蛛丝马迹还不足以做出定论，这位精于手段的美貌妃子，她的婚姻也就成了一个难以解开的谜。