刘瑾当权期间，施行了一系列的变法制度。这些变法内容涉及到百姓的生活、官员制度，乃至军事方面等等。他号召建立内行厂，目的就是为了铅制住当时的东厂和西厂的权力。因为，对于当时的人们来说，只要听到东厂和西厂的名号，都会闻风丧胆，六魂无主。刘瑾设立内行厂就有效的削弱了东厂和西厂的势力，一定程度上改变了当时的不正之气。

在刘瑾的变法内容里还包括减轻农民赋税。特别是那些受灾地区的赋税，刘瑾要求当地官员要及时把灾情上报给朝廷，及时将朝廷派送的补给分发到灾民手中，如果发现有官员贪赃枉法、中饱私囊，就会给予一定处罚。

除此之外，刘瑾还在军事方面进行改革。他仍在军队中设立文职，用以截至镇、巡以下的军队力量。对于以屯为单位的边防，刘瑾要求对其进行全面的检查，整顿清楚不合法度的为乱之事。

刘瑾虽为宦官，但也算得上是一个有着才能和谋略的宦官，他知道治国齐家并不是小孩过家家，应该慎重，并遵守法度。