在他父亲死后，安排大将军辅助朝政，独揽大权。，掌权后的他，制订了制定选拔官吏的制度，号召百官推荐贤能义士之才，上下整顿纲纪，任命文武大臣使各司职掌。司马师也具备卓越的军事才能，曾用巧计击溃吴国的军队。在公元255年时期，司马师在亲自率兵，准备要平定文钦之乱的时候，途中生病去世。后来晋朝建立，被追封为景皇帝。

关于他的眼睛，从生下来就伴有肿瘤疾病，很可能就是现代医学上所谓的“视网膜母细胞瘤”。就医学上的来说该疾病来源于光感受器前的体细胞的一种恶性肿瘤，具有家族遗传的可能，这种疾病若能及早治疗的话就有可能痊愈，提高治疗率。可惜他所处的时代是在三国时期，那时并没有像如今一样发达的医术来帮他们诊治，那是的他们只能好着“走一步，算一步的”的打算度过伴有眼疾的生活。

司马师处在一个兵荒马乱的时代，朝廷上防着被人算计。也正是朝政的尔虞我诈，使得在文钦之乱中，由于文钦的儿子打算袭击军营，司马师受到过度惊吓，再加上眼睛本身就有眼疾，导致眼睛经常流脓，眼睛就被震出眼眶。最终死于南昌。